Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms