Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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