Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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