Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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CNGA3Q16281 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CNGA3Q16281 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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