Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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COL19A1Q14993 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms