Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1SQ13698 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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