Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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