Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms