| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD27.1-201 | ENST00000516319 | 72 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.689-201 | ENST00000516589 | 107 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003469.3-201 | ENST00000518090 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AF117829.1-204 | ENST00000519854 | 284 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR5AL2P-201 | ENST00000532185 | 920 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01146-208 | ENST00000557355 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01894-201 | ENST00000580984 | 487 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC174048.1-201 | ENST00000603389 | 144 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL161798.1-201 | ENST00000604630 | 131 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC004492.1-201 | ENST00000607036 | 742 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AF250324.2-201 | ENST00000608299 | 610 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL157817.1-201 | ENST00000614264 | 790 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | 5S_rRNA.12-201 | ENST00000617631 | 107 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025034.2-201 | ENST00000623264 | 286 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC139792.3-201 | ENST00000623525 | 224 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PSMA5-201 | ENST00000271308 | 3729 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ROCK1P1-203 | ENST00000608049 | 2457 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TTN-204 | ENST00000360870 | 18218 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GTPBP8-205 | ENST00000473129 | 1518 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC022336.2-201 | ENST00000568966 | 2538 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC027514.1-201 | ENST00000588561 | 1603 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF680P1-201 | ENST00000436625 | 1469 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KCNT2-202 | ENST00000367433 | 5883 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GALNT1-201 | ENST00000269195 | 3847 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-61P-201 | ENST00000365528 | 109 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C1orf100-202 | ENST00000366537 | 483 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AKAP14-203 | ENST00000371425 | 793 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR454-201 | ENST00000390180 | 115 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA48.5-201 | ENST00000391143 | 135 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC068050.1-201 | ENST00000394891 | 380 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NDUFB4P4-201 | ENST00000404822 | 243 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS12P24-201 | ENST00000412619 | 387 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL353193.1-201 | ENST00000421444 | 268 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC012498.1-201 | ENST00000424037 | 437 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ISCA1P1-201 | ENST00000426679 | 387 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC114808.2-201 | ENST00000428335 | 536 nt | TSL 4 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL353612.1-201 | ENST00000428769 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL591212.2-201 | ENST00000433923 | 257 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CXorf51B-201 | ENST00000438525 | 436 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BNIP3P2-201 | ENST00000441221 | 577 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MRPS17P3-201 | ENST00000465453 | 385 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC006512.1-201 | ENST00000468816 | 291 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC109925.1-201 | ENST00000478069 | 331 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TAF8-207 | ENST00000482432 | 556 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093523.1-201 | ENST00000503268 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008871.1-201 | ENST00000510935 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CSN1S2AP-204 | ENST00000512167 | 671 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP001893.2-201 | ENST00000526949 | 202 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003033.1-201 | ENST00000527244 | 415 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC022240.1-201 | ENST00000532065 | 684 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HSPE1P7-201 | ENST00000604681 | 321 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL158032.1-201 | ENST00000605401 | 106 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC107294.1-201 | ENST00000609524 | 467 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | uc_338.1-201 | ENST00000612113 | 180 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359880.1-201 | ENST00000621879 | 266 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SEPT14P19-203 | ENST00000633205 | 211 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC068544.1-201 | ENST00000635064 | 248 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PHF6-201 | ENST00000332070 | 4759 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PPIP5K2-215 | ENST00000613674 | 4933 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND5P17-201 | ENST00000418405 | 1603 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DCUN1D1-201 | ENST00000292782 | 7954 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | API5P2-201 | ENST00000397055 | 1498 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GPR183-201 | ENST00000376414 | 1700 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FIGNL1-212 | ENST00000613602 | 3187 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PRKACB-219 | ENST00000614872 | 4306 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TOPORSLP1-203 | ENST00000493279 | 2871 nt | TSL 4 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL353743.1-202 | ENST00000431724 | 1695 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-70P-201 | ENST00000362618 | 164 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5-8SP4-201 | ENST00000365096 | 150 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-48P-201 | ENST00000365559 | 182 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CALM2P3-201 | ENST00000400429 | 449 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.619-201 | ENST00000410951 | 90 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC096664.2-201 | ENST00000411843 | 406 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AMD1P2-201 | ENST00000412936 | 992 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL445123.1-201 | ENST00000422023 | 446 nt | TSL 2 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092047.1-201 | ENST00000424997 | 240 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01817-201 | ENST00000429317 | 564 nt | TSL 4 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ARF4P2-201 | ENST00000430209 | 526 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND3P21-201 | ENST00000433774 | 331 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01810-201 | ENST00000450397 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NDUFA6-201 | ENST00000470753 | 475 nt | TSL 2 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL39P36-201 | ENST00000490784 | 156 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009269.3-201 | ENST00000558429 | 472 nt | TSL 5 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PWRN1-205 | ENST00000565295 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGB1P6-201 | ENST00000569046 | 646 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC011471.1-201 | ENST00000585766 | 187 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC022893.3-201 | ENST00000607665 | 437 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD39.4-201 | ENST00000620099 | 78 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CR381653.2-201 | ENST00000624041 | 768 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC068631.1-221 | ENST00000626006 | 592 nt | TSL 5 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL157786.1-207 | ENST00000627771 | 695 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL109837.2-201 | ENST00000632608 | 295 nt | TSL 3 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U6.114-201 | ENST00000636407 | 96 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CCDC141-202 | ENST00000409284 | 6960 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PGGT1B-203 | ENST00000419445 | 9545 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CCDC82-202 | ENST00000423339 | 1878 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC005183.1-201 | ENST00000603687 | 1979 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL589740.1-207 | ENST00000607823 | 1962 nt | TSL 5 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093010.3-201 | ENST00000570269 | 15214 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EBAG9-210 | ENST00000620557 | 2186 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.85 | | |