Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDKN3Q16667 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms