Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms