Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GRIK4Q16099 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms