Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms