Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GAPVD1Q14C86 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GAPVD1Q14C86 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms