Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SCARF1Q14162 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SCARF1Q14162 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms