Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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