Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCINQ13939 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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