Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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GTF2H2Q13888 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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GTF2H2Q13888 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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GTF2H2Q13888 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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