Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms