Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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