Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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