Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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