Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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