Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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LTBP3Q9NS15 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LTBP3Q9NS15 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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