Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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