Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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