Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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PRPF4BQ13523 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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PRPF4BQ13523 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRPF4BQ13523 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRPF4BQ13523 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRPF4BQ13523 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRPF4BQ13523 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRPF4BQ13523 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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