Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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MKRN4PQ13434 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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MKRN4PQ13434 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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MKRN4PQ13434 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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MKRN4PQ13434 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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MKRN4PQ13434 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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MKRN4PQ13434 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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