Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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