Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms