Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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