Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRRQ15256 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRRQ15256 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRRQ15256 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRRQ15256 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms