Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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CDH18Q13634 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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CDH18Q13634 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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