Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TMOD3Q9NYL9 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms