Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM23-201ENST00000231524 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CALCOCO1-210ENST00000548263 3888 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PDGFD-202ENST00000393158 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC064847.1-201ENST00000403125 506 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106017.1-202ENST00000424109 428 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104794.1-201ENST00000425235 312 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007952.3-202ENST00000435028 428 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073583.1-201ENST00000447553 400 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1B1P1-202ENST00000448124 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013480.1-201ENST00000451514 346 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPDHP45-201ENST00000452090 349 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB3L2-205ENST00000458726 776 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-92P-201ENST00000458830 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-173P-201ENST00000458903 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL724P-201ENST00000461895 271 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL526P-201ENST00000469492 319 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL451124.1-201ENST00000478520 1026 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA31.7-201ENST00000516287 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV7-27-201ENST00000522512 330 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KIRREL3-201ENST00000525144 3808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138512.1-201ENST00000563190 434 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005392.2-201ENST00000595748 301 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356458.1-201ENST00000604764 465 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAS-AS1_5.1-201ENST00000614281 121 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138894.4-201ENST00000616703 256 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FTX_5.1-201ENST00000618701 218 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM71F2-205ENST00000641605 5749 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNT2-201ENST00000294725 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA7-203ENST00000452168 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1H-201ENST00000310903 4364 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CPSF1P1-201ENST00000397477 3730 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFN11-201ENST00000308377 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK1-207ENST00000399914 3624 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026887.1-201ENST00000624657 2985 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF473-201ENST00000270617 4688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS6-219ENST00000622468 5453 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A9-205ENST00000507527 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ST6GALNAC1-201ENST00000156626 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP4-205ENST00000586305 3061 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K9-202ENST00000553414 3544 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms