Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
BCANQ96GW7 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms