Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms