Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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