Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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