Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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