| RUNX2 | Q13950 | TTN-AS1-263 | ENST00000627527 | 784 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ABBA01000935.2-201 | ENST00000637477 | 838 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PGGT1B-203 | ENST00000419445 | 9545 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TOPORSLP1-203 | ENST00000493279 | 2871 nt | TSL 4 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTN-204 | ENST00000360870 | 18218 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRIQK-204 | ENST00000517858 | 1882 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RXFP1-205 | ENST00000448688 | 3861 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HNRNPC-203 | ENST00000430246 | 4501 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP2B1-203 | ENST00000393164 | 3127 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WRN-201 | ENST00000298139 | 5215 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC6-212 | ENST00000618342 | 1754 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MCF2-202 | ENST00000370573 | 2583 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589740.1-207 | ENST00000607823 | 1962 nt | TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SYNE2-212 | ENST00000554584 | 20508 nt | TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1085P-201 | ENST00000363576 | 107 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1090P-201 | ENST00000364065 | 94 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-48P-201 | ENST00000365559 | 182 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TSHB-202 | ENST00000369517 | 474 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFB110-201 | ENST00000371148 | 384 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.450-201 | ENST00000384198 | 113 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2V1P2-201 | ENST00000397758 | 440 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC25P-201 | ENST00000408798 | 117 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00368-201 | ENST00000422994 | 650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAB3-AS1-201 | ENST00000428263 | 245 nt | TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006946.1-201 | ENST00000429106 | 328 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL606489.2-201 | ENST00000433886 | 234 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C4orf26-202 | ENST00000435974 | 560 nt | TSL 2 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018643.1-201 | ENST00000445459 | 414 nt | TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FGF7P6-202 | ENST00000451282 | 293 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133481.3-201 | ENST00000456546 | 333 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087588.1-201 | ENST00000462203 | 316 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079943.1-201 | ENST00000491909 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02101-201 | ENST00000505861 | 725 nt | TSL 4 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-27P-201 | ENST00000516185 | 142 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA40.12-201 | ENST00000516329 | 111 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CASP1P1-201 | ENST00000526345 | 212 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP5F1P5-201 | ENST00000526403 | 760 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5B10P-201 | ENST00000532869 | 642 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000786.1-201 | ENST00000541092 | 581 nt | TSL 4 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026333.2-201 | ENST00000542164 | 106 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC096558.1-203 | ENST00000550516 | 574 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NCAPGP2-201 | ENST00000557911 | 754 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009137.1-201 | ENST00000562790 | 260 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P6-201 | ENST00000569046 | 646 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4738-201 | ENST00000579134 | 87 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4775-201 | ENST00000581168 | 75 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3944-201 | ENST00000581277 | 108 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC178-211 | ENST00000581852 | 876 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008752.3-201 | ENST00000588113 | 712 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA51-201 | ENST00000606420 | 132 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093788.1-201 | ENST00000609356 | 927 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365204.3-201 | ENST00000612448 | 685 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001486.3-201 | ENST00000615334 | 372 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U6atac.1-201 | ENST00000616025 | 117 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6076-201 | ENST00000617521 | 113 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027309.3-201 | ENST00000623419 | 351 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIAA1524-206 | ENST00000491772 | 3877 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MACF1-201 | ENST00000289893 | 19141 nt | TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068647.1-201 | ENST00000489539 | 2265 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC019117.3-201 | ENST00000637807 | 3523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022336.2-201 | ENST00000568966 | 2538 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL6ST-205 | ENST00000381294 | 2574 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P17-201 | ENST00000418405 | 1603 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPR183-201 | ENST00000376414 | 1700 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGTR1-206 | ENST00000474935 | 1795 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATXN3-248 | ENST00000558190 | 26812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DDX60L-207 | ENST00000505890 | 4568 nt | TSL 2 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | P2RY13-201 | ENST00000325602 | 2764 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.256-201 | ENST00000364594 | 104 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-12P-201 | ENST00000365233 | 139 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP171-201 | ENST00000391071 | 115 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-47-201 | ENST00000391226 | 86 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAT1P1-201 | ENST00000406588 | 507 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR51A5P-201 | ENST00000415429 | 942 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092809.3-201 | ENST00000415453 | 231 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF241725.1-201 | ENST00000416182 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM167AP1-201 | ENST00000423409 | 219 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C21orf91-OT1-202 | ENST00000430815 | 717 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP5JP1-201 | ENST00000431631 | 322 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073063.1-201 | ENST00000434352 | 607 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL360169.1-201 | ENST00000435116 | 143 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL603839.2-201 | ENST00000437060 | 546 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTATP6P13-201 | ENST00000438531 | 667 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P23-201 | ENST00000446654 | 460 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358232.1-201 | ENST00000448030 | 501 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004888.1-201 | ENST00000450480 | 547 nt | TSL 2 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073326.1-201 | ENST00000451832 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CACYBPP2-201 | ENST00000453625 | 678 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027673.1-201 | ENST00000456245 | 405 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356010.1-201 | ENST00000456364 | 102 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP310-201 | ENST00000459084 | 116 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL594P-201 | ENST00000470590 | 287 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P5-201 | ENST00000471472 | 736 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MCCC1-AS1-201 | ENST00000471731 | 765 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC083798.1-201 | ENST00000472671 | 131 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098591.2-201 | ENST00000510152 | 315 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1282P-201 | ENST00000516735 | 96 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-835P-201 | ENST00000516974 | 104 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP60-201 | ENST00000516985 | 239 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090124.2-201 | ENST00000527727 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |