Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms