Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms