Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CPSF1Q10570 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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