Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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