Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP2O14595 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms