Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms