Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDP1Q9Y5B0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms