Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms