Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP22Q9UPT9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms